Король Шторм хочет лишить пони магии и захватывает Кантерлот. Под угрозой будущее всей Эквестрии! Чтобы остановить злодея, пони покидают родные края и отправляются в путешествие, полное чудес и опасностей. Им предстоит покорить волшебные горы, погрузиться в подводные миры и даже оказаться на летучем пиратском корабле!
Фильм повествует об удивительных приключениях маленького отважного мышонка по имени Фивел. Корабль, на котором он отправился в путешествие из России в Америку на рубеже 19 и 20 веков, был застигнут страшным штормом, и Фивел оказался один в открытом море.
Главный герой - восьмилетний мальчик Артур. Сюжет мультфильма разворачивается вокруг его жизни, где он сталкивается с настоящими проблемами, которые отнюдь не такие детские, как кажется на первый взгляд. Взаимоотношения с родителями и друзьями, обман, предательство, дружба и даже любовь.