Шиничи Кудо — детектив-старшеклассник, прозванный за свои потрясающие успехи в раскрытии самых сложных преступлений «современным Шерлоком Холмсом». Шиничи обожает вмешиваться в расследования полицейских и выводить преступников на чистую воду. Только вот однажды его любопытство сыграло с ним злую шутку. На свидании со своей подругой детства, Ран Мори , Шиничи стал свидетелем преступления, совершаемого загадочными людьми в чёрном. Само собой, мафиози не могли оставить знаменитого подростка в живых после всего того, что он видел и слышал. Люди в чёрном дали юному детективу отравленную пилюлю и скрылись в неизвестном направлении. Однако, вопреки ожиданиям преступников, яд оказал на мальчика иной…