Капитан Зоракс был лидером отряда вторжения трицератона в «Ночи Тёмной Черепахи». Будучи капитаном небольшого флота вторжения, Зоракс вторгся на Землю, заявив, что она является частью Империи Трицератонов, и планировал отправить его через свои звездные врата в свои родные миры и очистить его.
Леонардо сражался с ним только для того, чтобы потерпеть поражение. Однако план Зоракса был сорван, когда Донателло смог убедить Зоракса, что он был правителем Земли, а аниматронные динозавры из Музея естественной истории были его приспешниками. Он также использовал мощный микробластер Ороку Саки, чтобы убедить Зоракса, что он и его братья намного превосходят силы и способности трицератонов, в результате чего трицератоны покинули Землю.